سيدنا زكريا عليه السلام ذُكر في القرآن الكريم وفي الكتب السماوية أن نهايته كانت استشهاداً تقريباً على يد قومه، لكنه لم يُقتل بطريقة مفصلة تمامًا في القرآن. بعض التفاسير تقول إنه قُتل على يد قومه عندما دعا الله أن يرزقه ولداً رغم كبر سنه، وأنهم اعتدوا عليه بسبب دعوته وتصديقه للرسالة.
توسيع: بعض المصادر الإسلامية تشير إلى أن سيدنا زكريا استشهد عندما دخل إلى الهيكل أو المكان الذي كانوا فيه معارضيه، فأخذوه وقتلوه، ثم أوصى بالابن (يحيى عليه السلام) الذي جاء بعده. لا توجد تفاصيل دقيقة وموثوقة عن طريقة موته، لكنها عامةً تعتبر نهاية استشهادية بسبب إيمانه ودعوته للحق.